Список программного обеспечения и инструментов R

Программное обеспечение и инструменты для языка программирования R

Это список программного обеспечения и инструментов программирования для языка R, включая интегрированные среды разработки, менеджеры пакетов, библиотеки, инструменты отладки, средства для численных и научных вычислений, а также связанные проекты.

Интегрированные среды разработки (IDE) и редакторы[править | править код]

Emacs Speaks Statistics (ESS) — интерфейс Emacs для R и другого статистического программного обеспечения
Jupyter — поддерживает R через IRkernel
RKWard — среда разработки и графический интерфейс для R на основе KDE/Qt
RStudio — популярная кроссплатформенная IDE для R
StatET — среда разработки на основе Eclipse
Visual Studio Code — поддерживает R с помощью расширений (R Tools for Visual Studio)

Графические пользовательские интерфейсы[править | править код]

Deducer — графический интерфейс и пакет для анализа данных
jamovi — статистическая среда с графическим интерфейсом, построенная на R для анализа данных и выполнения статистических тестов
Java GUI for R — кроссплатформенная консоль R, редактор скриптов и представление данных в виде электронной таблицы
Rattle GUI — графический интерфейс для интеллектуального анализа данных в R
R Commander (Rcmdr) — базовый графический интерфейс для статистики в R, часто используемый для обучения и вводной работы.

Реализации R[править | править код]

CXXR — экспериментальный движок R с модернизированной кодовой базой на C++
FastR — реализация языка R на GraalVM
GNU R — основная реализация языка R, поддерживаемая R Core Team и распространяемая в рамках проекта GNU
pqR — «довольно быстрый R»
Renjin — интерпретатор R на основе виртуальной машины Java

Пакеты R[править | править код]

Bioconductor — репозиторий для пакетов R в области биоинформатики и вычислительной биологии
Comprehensive R Archive Network (CRAN) — основной репозиторий пакетов R
devtools — упрощает разработку пакетов R
Knitr — интеграция кода R в документы LaTeX, LyX, HTML, Markdown, AsciiDoc и reStructuredText
Packrat — система управления зависимостями
renv — система управления пакетами для конкретных проектов
R CMD build / R CMD check — инструменты сборки и проверки пакетов R
Tidyverse — коллекция пакетов, включающая ggplot2, dplyr и другие.

Математические и численные библиотеки[править | править код]

lme4 — линейные модели смешанных эффектов
Matrix — вычисления с разреженными и плотными матрицами
mgcv — обобщённые аддитивные модели
nlme — нелинейные модели смешанных эффектов
numDeriv — численное дифференцирование
optim — встроенные функции оптимизации
optimx — предоставляет замену и расширение пакета optim
Rmpfr — арифметика с плавающей запятой повышенной точности

Научные и статистические библиотеки[править | править код]

dplyr — набор инструментов для манипуляции данными
edgeR — анализ дифференциальной экспрессии данных RNA-seq
forecast — прогнозирование временных рядов
ggplot2 — визуализация данных на основе грамматики графиков
phyloseq — анализ данных микробиомных переписей
Shiny — фреймворк для создания интерактивных веб-приложений
survival — анализ выживаемости
tidyr — преобразование данных к «аккуратному» виду

Инструменты отладки и анализа производительности[править | править код]

bench — точное бенчмаркирование и анализ времени выполнения
lineprof — инструмент построчного профилирования
microbenchmark — бенчмаркинг
profvis — интерактивный профайлер R
Rcpp — интеграция R и C++ для повышения производительности
Rprof — встроенный профайлер R

Параллельные и высокопроизводительные вычисления[править | править код]

BiocParallel — фреймворк параллельных вычислений для R, используемый в пакетах Bioconductor
doParallel — предоставляет бэкенд для параллельного выполнения пакета foreach
foreach — конструкция цикла для параллельного выполнения
future — унифицированные параллельные и распределённые вычисления
parallel — встроенный пакет R для параллельной обработки
Rmpi — интерфейс R для Message Passing Interface (MPI)
snow — простая сеть рабочих станций

Библиотеки машинного обучения и искусственного интеллекта[править | править код]

caret — обучение и настройка моделей машинного обучения
keras — интерфейс R к библиотеке глубокого обучения Keras
mlbench — коллекция искусственных и реальных наборов данных для оценки алгоритмов машинного обучения
mlr — машинное обучение
mlr3 — современный преемник пакета mlr
randomForest — ансамблевое обучение с использованием случайных лесов
tidymodels — коллекция пакетов R для машинного обучения и моделирования, разработанная в соответствии с принципами tidyverse
torch — интерфейс R к PyTorch
xgboost — фреймворк градиентного бустинга с привязками к R

Инструменты документации и анализа кода[править | править код]

covr — оценка покрытия тестами
lintr — статический анализ кода
roxygen2 — генерация документации для пакетов R
styler — форматировщик кода для скриптов и пакетов R

Фреймворки тестирования[править | править код]

checkmate — быстрая проверка аргументов и утверждений для функций R
RUnit — реализация стандартного фреймворка модульного тестирования
testthat — фреймворк модульного тестирования
tinytest — облегчённый фреймворк модульного тестирования

См. также[править | править код]

Наука о данных
gretl — свободное программное обеспечение для эконометрики, которое может интегрироваться с R
Список численных библиотек
Списки программного обеспечения для разработки
Статистическое программное обеспечение
R Programming на Викиучебнике

Внешние ссылки[править | править код]

Ссылки[править | править код]